Après avoir enseigné pendant plus de 35 ans à l’Université de Paris-Diderot (Paris 7) (1971-2006), Jean Gaudant a été chercheur attaché au Muséum national d’Histoire naturelle. Spécialiste de paléontologie des vertébrés, il a poursuivi un programme de recherches paléoichthyologiques sur le peuplement des eaux douces européennes au cours du Cénozoïque. Il a terminé parallèlement l’étude de l’ichthyofaune miocène et pliocène du bassin méditerranéen (Maroc, Algérie, Espagne, Italie, Grèce et Chypre), dans le cadre de recherches sur la crise écologique qui a affecté la Méditerranée au Messinien.
Il a par ailleurs été fortement impliqué dans les activités du Comité français d’Histoire de la Géologie (COFRHIGÉO), dont il a édité, à partir de 1991 et jusqu’à son décès, le volume annuel des Travaux.
Il a à son actif de nombreuses publications sur l’histoire de la paléontologie et, plus particulièrement, sur la naissance de cette science à la fin du XVIIe siècle et au début du siècle suivant.
Il a également assuré l’édition de plusieurs ouvrages d’histoire de la géologie et a dirigé une série d’ouvrages consacrés à l’Histoire de la Découverte géologique de la France (Presses des Mines), dont l’objectif était de faire connaître les modalités de l’étude géologique de notre territoire.